More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1184 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 479 aa  996    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.27 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  44.8 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.47 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.87 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.42 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.73 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.34 
 
 		 470 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 469 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  40.43 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.89 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.69 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.25 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  41.2 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  39.49 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 481 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.65 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  39.23 
 
 		 473 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.4 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 491 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 473 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 478 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 473 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 470 aa  355  8.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  39.61 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 489 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 475 aa  352  7e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 500 aa  352  8e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 532 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.2 
 
 		 498 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.12 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.75 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  40 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 471 aa  346  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 475 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  38.63 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.56 
 
 		 517 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 478 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 494 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 482 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 491 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 479 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 473 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 476 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 472 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 472 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  35.56 
 
 		 493 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  37.69 
 
 		 504 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>