More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1932 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 476 aa  960    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  44.28 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  44.99 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  44.56 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  42.92 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  42.49 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  42.98 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  44.28 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.95 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  41.85 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 491 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.68 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  42.68 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 470 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.34 
 
 		 475 aa  364  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.33 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  42.56 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.44 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  40.9 
 
 		 475 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.11 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 473 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.28 
 
 		 480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.28 
 
 		 492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  38.12 
 
 		 471 aa  356  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  45.4 
 
 		 482 aa  355  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  40.94 
 
 		 479 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 473 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 479 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.51 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 469 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.85 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  43.2 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 481 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  43.63 
 
 		 474 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  43.8 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  42.92 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.83 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 		 479 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 470 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  42.22 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 476 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 470 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 473 aa  345  8.999999999999999e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  43.32 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  43.63 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.1 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>