More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2000 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  90.3 
 
 		 530 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  85.36 
 
 		 479 aa  862    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  98.33 
 
 		 479 aa  972    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  100 
 
 		 479 aa  986    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  93.67 
 
 		 479 aa  902    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 502 aa  840    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  90.3 
 
 		 509 aa  886    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  90.59 
 
 		 480 aa  894    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  85.36 
 
 		 479 aa  862    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  90.51 
 
 		 480 aa  885    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.47 
 
 		 492 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.63 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 476 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  41.97 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.42 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  41.74 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  40.9 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.65 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  39.92 
 
 		 473 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 477 aa  358  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  39.45 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.39 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.83 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  39.48 
 
 		 473 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.48 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 482 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 491 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  40.9 
 
 		 473 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 469 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.63 
 
 		 473 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  40.65 
 
 		 472 aa  352  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  38.34 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 469 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 475 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.13 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 476 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  38.13 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.26 
 
 		 483 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 473 aa  349  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.46 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.08 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 475 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  39.19 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.15 
 
 		 470 aa  346  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 504 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.24 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  37.69 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.21 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  38.85 
 
 		 473 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 474 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 479 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 473 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.53 
 
 		 472 aa  342  7e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>