More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0494 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  73.4 
 
 		 470 aa  770    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  72.55 
 
 		 470 aa  764    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  72.55 
 
 		 470 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  64.18 
 
 		 478 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  71.68 
 
 		 471 aa  738    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  63.75 
 
 		 474 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  72.98 
 
 		 470 aa  766    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  73.19 
 
 		 470 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 471 aa  979    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  63.3 
 
 		 479 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 473 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  58.61 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  56.53 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  56.56 
 
 		 473 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  55.82 
 
 		 476 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  56.25 
 
 		 474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  55.72 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  55.72 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  55.82 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 473 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 478 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  39.35 
 
 		 479 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 479 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 479 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 502 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 530 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  38.7 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.26 
 
 		 475 aa  332  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 478 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 469 aa  329  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.28 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.49 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 487 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 482 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 473 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.79 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 479 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 473 aa  319  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 532 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 476 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 477 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 492 aa  313  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 469 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  37.23 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  36.4 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.09 
 
 		 487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 478 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.34 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.33 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.63 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.84 
 
 		 479 aa  306  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 475 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  33.98 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 491 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  32.47 
 
 		 468 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.87 
 
 		 498 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>