More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3949 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 473 aa  979    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  43.16 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  43.38 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  42.64 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 530 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.96 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  40.43 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.55 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.15 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.4 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 487 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.22 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 472 aa  353  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 473 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 471 aa  353  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 491 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  40 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.75 
 
 		 483 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 532 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 477 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 478 aa  339  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.92 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  38.49 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 473 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.26 
 
 		 473 aa  336  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 473 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 477 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 475 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  38.31 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 474 aa  333  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 474 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 474 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 473 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 476 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.12 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.73 
 
 		 475 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 475 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 477 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  40.57 
 
 		 433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 478 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 474 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 478 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  36.36 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  36.36 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  36.36 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  36.36 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 472 aa  326  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 473 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>