More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1450 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 504 aa  1052    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  55.93 
 
 		 482 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  52.97 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  52.12 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  52.85 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 473 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  52.39 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  53.13 
 
 		 474 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 473 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  53.35 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  50.84 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.65 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.17 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.16 
 
 		 470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.68 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  48.16 
 
 		 470 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  48.03 
 
 		 471 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.19 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 478 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 487 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 483 aa  356  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 475 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 475 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 474 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 474 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 474 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 475 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 479 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 474 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  37.13 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.36 
 
 		 470 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.29 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.11 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 471 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.89 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  36.5 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 480 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 473 aa  336  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.75 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.91 
 
 		 477 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 473 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 473 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 475 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 477 aa  329  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 491 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  37 
 
 		 469 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  36.89 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.54 
 
 		 474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>