More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2744 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  73.21 
 
 		 473 aa  728    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  73.57 
 
 		 472 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  92.34 
 
 		 483 aa  922    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 483 aa  989    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 473 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  62.03 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  62.03 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  62.03 
 
 		 468 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  62.03 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  62.03 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 468 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  61.64 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  61.64 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  62.03 
 
 		 474 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  61.64 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  62.03 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  63.91 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.26 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  57.84 
 
 		 470 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  63.16 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 470 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  52.94 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 487 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  47.88 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  47.79 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 473 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  49.57 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  48.73 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.62 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 469 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  48.41 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 470 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  46.92 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 469 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.11 
 
 		 470 aa  445  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 481 aa  445  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  47.67 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  46.17 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  46.7 
 
 		 482 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  45.42 
 
 		 483 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 477 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.14 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.08 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.17 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 481 aa  412  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  42.46 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 473 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  43.25 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 473 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  40.92 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  41.44 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>