More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1939 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  100 
 
 		 476 aa  979    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 475 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 474 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  37.92 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 474 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 474 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  37.42 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 474 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.01 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 509 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 474 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 502 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 469 aa  326  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 473 aa  325  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.18 
 
 		 492 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.25 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 478 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 532 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.78 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 473 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 478 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 479 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 514 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.62 
 
 		 477 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.39 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 469 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 497 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.78 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.27 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  35.17 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.77 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 494 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 477 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 477 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.55 
 
 		 474 aa  300  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  33.76 
 
 		 500 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.12 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  34.26 
 
 		 504 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.98 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  35.61 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  32.69 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  32.69 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  32.69 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  32.69 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  32.69 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.1 
 
 		 487 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 475 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 478 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>