More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1599 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 475 aa  982    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.28 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.85 
 
 		 492 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  39.75 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  40.9 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  39.57 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 469 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.22 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.62 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.1 
 
 		 472 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 470 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 474 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 491 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 474 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.19 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.74 
 
 		 487 aa  359  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 474 aa  359  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  38.92 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 469 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 481 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 473 aa  356  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 477 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 496 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.54 
 
 		 474 aa  355  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 496 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.69 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.71 
 
 		 479 aa  352  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  37.77 
 
 		 474 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 476 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 469 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 479 aa  349  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  37.2 
 
 		 474 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  37.12 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  37.34 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 489 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  38.53 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 479 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  38.59 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 479 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 479 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 479 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.94 
 
 		 477 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 478 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 478 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.13 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.81 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>