More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4761 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  100 
 
 		 471 aa  978    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  97.6 
 
 		 470 aa  929    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  97.38 
 
 		 470 aa  923    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  71.68 
 
 		 471 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  98.26 
 
 		 470 aa  936    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  97.17 
 
 		 470 aa  925    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  97.39 
 
 		 470 aa  926    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  59.44 
 
 		 478 aa  596  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.79 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.46 
 
 		 479 aa  568  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  57.08 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 473 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  56.19 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.27 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  55.43 
 
 		 482 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  54.05 
 
 		 476 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  54.49 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  55.14 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  55.14 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 478 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  38.58 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 483 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 479 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 502 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.82 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 469 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  37.69 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 478 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 530 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.83 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.6 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.72 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.83 
 
 		 487 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.72 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.84 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 469 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 532 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 475 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 471 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 473 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.02 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.02 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.07 
 
 		 500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  36.67 
 
 		 493 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.74 
 
 		 484 aa  302  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 487 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 474 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 475 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 474 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 475 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 476 aa  299  9e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.48 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  34.62 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>