More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0240 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  71.55 
 
 		 476 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 496 aa  720    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  67.3 
 
 		 482 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  69.85 
 
 		 473 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  70.49 
 
 		 473 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  70.49 
 
 		 473 aa  711    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 473 aa  963    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  72.09 
 
 		 496 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  69.51 
 
 		 474 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  71.46 
 
 		 496 aa  722    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  69.94 
 
 		 474 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.91 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  60.13 
 
 		 478 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 471 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.84 
 
 		 470 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.51 
 
 		 476 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  54.84 
 
 		 470 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  54.62 
 
 		 470 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 470 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.74 
 
 		 479 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  53.98 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  40.04 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 475 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 478 aa  359  7e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  39.45 
 
 		 479 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 479 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  39.7 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  39.7 
 
 		 479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 476 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.25 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 532 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.95 
 
 		 492 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.73 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 502 aa  349  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 474 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 474 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 530 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 509 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 474 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 474 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 480 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 472 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 474 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  40.13 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  39.28 
 
 		 492 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 473 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.23 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 474 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.9 
 
 		 475 aa  340  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.48 
 
 		 479 aa  339  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.43 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 469 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 478 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 477 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.68 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 482 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 481 aa  333  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 491 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  39.22 
 
 		 500 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 470 aa  325  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  40.63 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>