More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3431 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.09 
 
 		 517 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 492 aa  1002    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  55.74 
 
 		 504 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.11 
 
 		 487 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  56.71 
 
 		 487 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  56.28 
 
 		 495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 606 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  51.56 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  52.6 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 494 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.94 
 
 		 498 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 521 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  48.35 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  40.42 
 
 		 492 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 483 aa  338  9e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 469 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.8 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.53 
 
 		 479 aa  328  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 504 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.17 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 473 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.8 
 
 		 492 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.05 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.99 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 496 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 476 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 476 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  39.67 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 491 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  38.54 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.76 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.59 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 480 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 469 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  37.47 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.13 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  38.28 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.63 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  37.92 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  35.42 
 
 		 471 aa  296  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 470 aa  296  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 470 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  35.89 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 502 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 477 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.1 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.13 
 
 		 487 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.97 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 470 aa  292  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 482 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 476 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 488 aa  290  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 470 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 474 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  36.02 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 481 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 473 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 477 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>