More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2661 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 483 aa  983    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.87 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  59.28 
 
 		 504 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 492 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  59.32 
 
 		 487 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.53 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 606 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  56.75 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  54.35 
 
 		 495 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 497 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  51.57 
 
 		 494 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.82 
 
 		 498 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  51.05 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 521 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  47.82 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.09 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 483 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 478 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  40 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.51 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.29 
 
 		 480 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 469 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.92 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.98 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  38.33 
 
 		 500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 471 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 478 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 470 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 		 474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.41 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 496 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.13 
 
 		 472 aa  312  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.29 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.06 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 491 aa  309  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 504 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 481 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.65 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  35.38 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  36.84 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.15 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 480 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 479 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 469 aa  302  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  37.66 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 509 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  34.33 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>