More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3430 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 521 aa  1045    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  60.83 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.72 
 
 		 517 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  51.32 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  52.03 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.24 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  53.21 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  51.86 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  51.14 
 
 		 494 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  50.84 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 606 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.2 
 
 		 498 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 471 aa  310  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 478 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 487 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 483 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 492 aa  303  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.95 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 483 aa  289  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.79 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  39.21 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  37.03 
 
 		 469 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 		 479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 489 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 474 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.27 
 
 		 473 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.14 
 
 		 483 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 482 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 477 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 475 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  36.63 
 
 		 500 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.67 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 532 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.59 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 496 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 474 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 474 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.99 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 481 aa  274  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 473 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 477 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  35.91 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 474 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 477 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 477 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 477 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  38.45 
 
 		 473 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  38.45 
 
 		 473 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  34.38 
 
 		 468 aa  272  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  38.45 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.79 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.49 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>