More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0868 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  70.02 
 
 		 478 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 606 aa  1243    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  58.14 
 
 		 504 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.03 
 
 		 517 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.87 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  58.99 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  55.32 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  52.27 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.87 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 497 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  50.41 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  53.07 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  43.7 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.81 
 
 		 479 aa  336  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 483 aa  323  8e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.79 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 487 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.68 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 479 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.12 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 480 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  38.56 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 483 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 478 aa  300  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 530 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 509 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 473 aa  298  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 474 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  37.16 
 
 		 479 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 474 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 474 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.89 
 
 		 475 aa  294  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 502 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 474 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 474 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  35.41 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 496 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 476 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.92 
 
 		 486 aa  289  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.44 
 
 		 472 aa  289  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  37.71 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 473 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 471 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 470 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 		 487 aa  287  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 496 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 477 aa  287  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 474 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 474 aa  287  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 469 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.67 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4286  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 497 aa  284  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 470 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  33.89 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  38.62 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  36.38 
 
 		 472 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.98 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.75 
 
 		 484 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 481 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 482 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 479 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>