More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5367 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  100 
 
 		 494 aa  993    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  60.83 
 
 		 521 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  53.8 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  52.71 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  53.7 
 
 		 487 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.14 
 
 		 487 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  52.11 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  52.7 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  53.3 
 
 		 606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.41 
 
 		 517 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  47.82 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.13 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.84 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 475 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.85 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 496 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.01 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 532 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 473 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.9 
 
 		 487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  36.42 
 
 		 479 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 479 aa  273  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 470 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 478 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 479 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.74 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 502 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  37.37 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  34.85 
 
 		 471 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  34.74 
 
 		 470 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 474 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 480 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  35.4 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 530 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 477 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 491 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.04 
 
 		 492 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.36 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 473 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 478 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.8 
 
 		 480 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 469 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.65 
 
 		 475 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>