More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1173 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  97.94 
 
 		 486 aa  958    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  68.52 
 
 		 488 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  100 
 
 		 486 aa  999    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.61 
 
 		 480 aa  445  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1936  GntR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.6 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  43.19 
 
 		 492 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5620  GntR family transcriptional regulator  53.67 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 478 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 483 aa  352  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 479 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 469 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  38.46 
 
 		 479 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 530 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 494 aa  336  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.5 
 
 		 479 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.27 
 
 		 477 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 492 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.74 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.53 
 
 		 487 aa  327  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 469 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 474 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  38.87 
 
 		 504 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.72 
 
 		 517 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  39.5 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 487 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.1 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  36.99 
 
 		 493 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.96 
 
 		 479 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 473 aa  319  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.52 
 
 		 487 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 474 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 474 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 472 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.78 
 
 		 487 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  36.05 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  36.7 
 
 		 463 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 477 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>