More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1936 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1936  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 427 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.73 
 
 		 486 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.97 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  46.41 
 
 		 488 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.84 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5620  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 378 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.1 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.1 
 
 		 492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 		 479 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  38.5 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 487 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 483 aa  293  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 469 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 469 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 473 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.51 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 504 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 474 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 483 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 494 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 473 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 474 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 469 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 475 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.6 
 
 		 487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  37.03 
 
 		 474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 473 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.97 
 
 		 474 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.82 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 474 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 477 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 477 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  34.43 
 
 		 500 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  36.32 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 474 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 474 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 491 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.05 
 
 		 470 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 492 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 530 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 477 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.06 
 
 		 484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 470 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 481 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.1 
 
 		 477 aa  266  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 471 aa  266  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 473 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 473 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 494 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 473 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 532 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.94 
 
 		 479 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.74 
 
 		 487 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  35.14 
 
 		 504 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.88 
 
 		 517 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.74 
 
 		 487 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 496 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.6 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  35.53 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>