More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5620 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5620  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 378 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.89 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  53.67 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.96 
 
 		 486 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  58.11 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1936  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 427 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.62 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.62 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.5 
 
 		 477 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 487 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 478 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 472 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 532 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 478 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  39.82 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.21 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  42.18 
 
 		 472 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 474 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 489 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 476 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 473 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 504 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.38 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.92 
 
 		 475 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.99 
 
 		 472 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  39.31 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.23 
 
 		 498 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  40 
 
 		 477 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 477 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 469 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 479 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.73 
 
 		 483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 481 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.93 
 
 		 517 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 477 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.69 
 
 		 487 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.59 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  39.3 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.79 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  42.82 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 472 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.29 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 470 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 483 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 497 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.97 
 
 		 483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.43 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  37.29 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  38.73 
 
 		 493 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 472 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.48 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.71 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 470 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  37.61 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.76 
 
 		 487 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 470 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>