More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0356 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 520 aa  1032    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  96.92 
 
 		 519 aa  1004    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  43.93 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.58 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.48 
 
 		 498 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.14 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 477 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 450 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 402 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 477 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.71 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  27.25 
 
 		 417 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  25.05 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  27.65 
 
 		 397 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.48 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.15 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 481 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  26.18 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.34 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 401 aa  183  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  27.01 
 
 		 402 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  27.32 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27.98 
 
 		 480 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 468 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 547 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.89 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 397 aa  180  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.17 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  27.09 
 
 		 406 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  26.68 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 401 aa  177  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 409 aa  176  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 513 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.54 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  24.49 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.32 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  28.79 
 
 		 399 aa  173  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  26.26 
 
 		 395 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  25.96 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.09 
 
 		 465 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 398 aa  170  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  27.21 
 
 		 396 aa  170  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.01 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 496 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  23.52 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 506 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 506 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.78 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.84 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 477 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.84 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>