More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0901 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 554 aa  1138    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.27 
 
 		 517 aa  276  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 498 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 409 aa  257  5e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.69 
 
 		 397 aa  253  9.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 397 aa  253  9.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  36.6 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 399 aa  248  3e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 425 aa  246  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 401 aa  238  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 401 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 386 aa  236  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  35.79 
 
 		 398 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 383 aa  234  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 520 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  33.16 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 396 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 477 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 477 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 402 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  33.67 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  32.92 
 
 		 393 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 477 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 377 aa  223  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.6 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 393 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.27 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.15 
 
 		 485 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 463 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 461 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 477 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 386 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  32.42 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  32.17 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 		 397 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  32.17 
 
 		 393 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  34.42 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  35.01 
 
 		 398 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  32.41 
 
 		 394 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 394 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  32.42 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  32.42 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  32.75 
 
 		 406 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  31.25 
 
 		 344 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.07 
 
 		 490 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 438 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 500 aa  213  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 481 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  39.81 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.59 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  39.46 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  39.46 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 480 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 		 406 aa  212  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 		 400 aa  210  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  31.81 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 480 aa  210  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 416 aa  210  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  39.33 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>