More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0766 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 383 aa  781    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  51.71 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  50.79 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  49.74 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  50.79 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  51.97 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  51.18 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  51.18 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  50.65 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  49.61 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  48.69 
 
 		 404 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 395 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  50.52 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  50.52 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  50.39 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  49.09 
 
 		 398 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  49.48 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  50.65 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  50.65 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  50.65 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  50.65 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  50.65 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  50.65 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  50.26 
 
 		 417 aa  352  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  46.88 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  43.34 
 
 		 396 aa  345  8.999999999999999e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 340 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  45.65 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  48.2 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  47.84 
 
 		 377 aa  335  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 397 aa  332  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 388 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  43.5 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  49.33 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  43.41 
 
 		 463 aa  322  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  45.08 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  45.08 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  48.31 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 		 426 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  44.39 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 405 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 395 aa  311  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  48.29 
 
 		 410 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  41.99 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  42.53 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  42.75 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  43.46 
 
 		 438 aa  305  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  40.9 
 
 		 397 aa  305  7e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  42.08 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  44.42 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  45.27 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  43.32 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  43.32 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  42.24 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  41.32 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.8 
 
 		 446 aa  301  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  42.56 
 
 		 611 aa  301  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  40.53 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.86 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  41.32 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  46.32 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  43.72 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 410 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  41.73 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  40.41 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 414 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  45.55 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.52 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 391 aa  295  7e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 393 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>