More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4583 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  94.51 
 
 		 437 aa  834    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 437 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  69.25 
 
 		 414 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  63.22 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 441 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  60.18 
 
 		 437 aa  541  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  62.27 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  61.2 
 
 		 439 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  59.03 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  62.76 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  59.12 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  58.85 
 
 		 611 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  57.83 
 
 		 436 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  59.91 
 
 		 440 aa  511  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  59.9 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  58.89 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  56.45 
 
 		 440 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 416 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  59.09 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  52.87 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  48.41 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  47.67 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  44.17 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  42.89 
 
 		 463 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  42.17 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  41.27 
 
 		 399 aa  319  6e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  41.04 
 
 		 404 aa  309  6.999999999999999e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  44.42 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 409 aa  302  7.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.01 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 413 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.75 
 
 		 394 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.42 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  44.61 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  39.29 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.12 
 
 		 420 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.99 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 340 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.71 
 
 		 406 aa  266  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.28 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.28 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.23 
 
 		 394 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.28 
 
 		 393 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.29 
 
 		 417 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.47 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 		 396 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 411 aa  264  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.52 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  37.47 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.2 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  37.87 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  37.87 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.92 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 416 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 393 aa  249  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>