More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2514 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
397 aa  823    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  63.1 
 
 
401 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  53.32 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
392 aa  425  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  52.15 
 
 
394 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  48.71 
 
 
393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  51.4 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  48.84 
 
 
399 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  45.5 
 
 
400 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  49.1 
 
 
388 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  44.76 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  44.62 
 
 
393 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  45.01 
 
 
393 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
393 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  44.5 
 
 
393 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
395 aa  344  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  44.25 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  44.25 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  42.86 
 
 
417 aa  342  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  44.5 
 
 
393 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  44.5 
 
 
393 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  44.5 
 
 
393 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
398 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  44.5 
 
 
393 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  44.5 
 
 
393 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  44.62 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 
398 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  41.53 
 
 
395 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  41.71 
 
 
398 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 
395 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
399 aa  329  4e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
405 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  42.97 
 
 
396 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  42.97 
 
 
396 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  42.45 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 
406 aa  319  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  40.76 
 
 
397 aa  319  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  41.75 
 
 
404 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  41.99 
 
 
394 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.9 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  39.6 
 
 
420 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  41.76 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
426 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  40.9 
 
 
426 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
450 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
340 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  41.16 
 
 
416 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
398 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
407 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
413 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.87 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  39.5 
 
 
411 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 
400 aa  275  7e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 
463 aa  275  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.47 
 
 
386 aa  272  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
411 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
426 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.22 
 
 
397 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  36.55 
 
 
402 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.43 
 
 
446 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  35.7 
 
 
437 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  37.81 
 
 
410 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
403 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  37.81 
 
 
410 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
410 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 
405 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 
440 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
399 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
411 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
411 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
409 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 
377 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
398 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
390 aa  258  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  35.01 
 
 
446 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 
406 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  34.53 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.13 
 
 
438 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 
441 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
411 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  37.06 
 
 
440 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
430 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
397 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 
394 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 
432 aa  250  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  34.94 
 
 
395 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
399 aa  249  7e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.66 
 
 
439 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000612  transcriptional regulator GntR family/aspartate aminotransferase  35.81 
 
 
382 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.379678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>