More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3332 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  81.91 
 
 		 393 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  81.41 
 
 		 393 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  97.49 
 
 		 398 aa  793    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  81.41 
 
 		 393 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  81.41 
 
 		 393 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  81.41 
 
 		 393 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  82.16 
 
 		 393 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  81.41 
 
 		 393 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  81.66 
 
 		 393 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  81.66 
 
 		 393 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  80.65 
 
 		 393 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  81.66 
 
 		 393 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  81.91 
 
 		 393 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  81.41 
 
 		 393 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  89.2 
 
 		 398 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  81.66 
 
 		 393 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  81.41 
 
 		 393 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  65.97 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  64.32 
 
 		 406 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  65.97 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  65.03 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  65.03 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  66.75 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  52.1 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  54.17 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  55.31 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  52.08 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 383 aa  362  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  47.41 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 395 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  49.75 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  44.7 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  45.88 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 395 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  44.79 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  41.71 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 393 aa  329  7e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  42.32 
 
 		 405 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  47.51 
 
 		 377 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.55 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  42.89 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  49.34 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  43.28 
 
 		 410 aa  312  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  43.28 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  41.07 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  40.97 
 
 		 433 aa  308  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.15 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  44.11 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  42.25 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 435 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  40.15 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  38.87 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 		 395 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.79 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40.05 
 
 		 441 aa  292  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  43.08 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.23 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.64 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>