More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5490 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 377 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 395 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  62.7 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  62.66 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  62.95 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 383 aa  335  9e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  46.34 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  48.29 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  48.03 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  48.03 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  47.51 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  47.24 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 393 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  47.51 
 
 		 393 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  44.99 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  46.84 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  45.79 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  42.74 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  44.88 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  44.7 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  44.7 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  46.34 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  45.45 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  43.16 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  45.79 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  45.79 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  45.79 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  45.79 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  45.79 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  45.79 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  42.82 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  41.73 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 395 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  45 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  43.57 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  43.83 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  43.83 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  44.76 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  45.62 
 
 		 399 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  45.36 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  41.78 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  45.95 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  41.09 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  42.44 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  40.05 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  44.56 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  39.16 
 
 		 396 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 393 aa  285  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  44.14 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  43.48 
 
 		 437 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  40.71 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 		 463 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 416 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  42.34 
 
 		 436 aa  281  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.52 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  41.99 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  44.92 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 340 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  47.35 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  47.35 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  47.35 
 
 		 408 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  43.44 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 426 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 437 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  41.19 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  40.52 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>