More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  100 
 
 		 436 aa  885    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  76.32 
 
 		 436 aa  699    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  75.93 
 
 		 611 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  71.96 
 
 		 438 aa  647    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  65.97 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  64.67 
 
 		 437 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  63.13 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  66.5 
 
 		 446 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  63 
 
 		 441 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  62.97 
 
 		 446 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  63.53 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 437 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  57.83 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  61.24 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  56.63 
 
 		 440 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  60.78 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  58.6 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  54.96 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  44.52 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  45.99 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.96 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  44.47 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  44.47 
 
 		 404 aa  329  7e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 395 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 403 aa  304  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 399 aa  302  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.2 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.64 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  39.23 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  39.41 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 401 aa  285  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 396 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 411 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 396 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.99 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 		 377 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  42.31 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.24 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  34.61 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.66 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.48 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.99 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.54 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.99 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.24 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.24 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.24 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.24 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.24 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.24 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.53 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  38.15 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 340 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 403 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 401 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  36.79 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 411 aa  264  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 411 aa  264  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 398 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  36.79 
 
 		 410 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.99 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>