More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0708 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  100 
 
 		 400 aa  831    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  47.68 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 401 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  45.5 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.98 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  43.65 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  42.82 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  42.93 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 395 aa  329  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  42.71 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  42.11 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  42.6 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  41.97 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  42.08 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  41.41 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  41.24 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  41.24 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  41.93 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  41.93 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  41.93 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  41.93 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  42.08 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  42.08 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  41.93 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  41.93 
 
 		 393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  42.08 
 
 		 393 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  42.71 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  42.59 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  41.56 
 
 		 393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 426 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 426 aa  308  8e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 398 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 398 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  39.54 
 
 		 397 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  39.11 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  38.46 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  38.19 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.19 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.23 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.23 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 405 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  37.87 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 408 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  39.53 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 410 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 406 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 395 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  35.23 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  33 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  39.05 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  35.77 
 
 		 402 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>