More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2084 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
406 aa  813    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  55.05 
 
 
397 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  55.28 
 
 
405 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  52.75 
 
 
417 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  51.78 
 
 
406 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  51.23 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  50.49 
 
 
393 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  50.74 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
395 aa  382  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  50.74 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  50.74 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  50.25 
 
 
398 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  49.75 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  50.25 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  50.76 
 
 
396 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  50.76 
 
 
396 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
395 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  49.75 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  49.75 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  49.75 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  49.75 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
395 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  47.39 
 
 
404 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  49 
 
 
398 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  49.75 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  49.75 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  49.36 
 
 
394 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 
395 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 
383 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 
396 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  45.2 
 
 
397 aa  342  5.999999999999999e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.6 
 
 
394 aa  342  9e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  43.97 
 
 
401 aa  341  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
406 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  48.14 
 
 
406 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
410 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
408 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  45.79 
 
 
410 aa  332  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  46.9 
 
 
411 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  45.79 
 
 
410 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
450 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 
397 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  44.75 
 
 
404 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  45.36 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  45.23 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  48.29 
 
 
426 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  45.39 
 
 
402 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  42.61 
 
 
400 aa  322  5e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  42.71 
 
 
400 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  45.14 
 
 
402 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  47.4 
 
 
416 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  43.55 
 
 
420 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
388 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
407 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  48.63 
 
 
340 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  45.71 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  42.89 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.19 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
395 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
400 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 
398 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
398 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  41.65 
 
 
386 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 
395 aa  298  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
399 aa  296  4e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  41.19 
 
 
438 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 
440 aa  294  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  45.66 
 
 
426 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 
401 aa  293  4e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.05 
 
 
395 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 
463 aa  293  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  46.52 
 
 
402 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.55 
 
 
395 aa  292  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 
437 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 
395 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  41.67 
 
 
399 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
401 aa  290  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  43.44 
 
 
377 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  39.76 
 
 
433 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 
396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 
399 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  40.9 
 
 
438 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  40.3 
 
 
397 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  40.35 
 
 
611 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 
433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  41.21 
 
 
432 aa  282  8.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
413 aa  279  5e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
392 aa  279  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>