More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2616 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
395 aa  823    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  47.72 
 
 
396 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 
394 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
393 aa  355  6.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  43.65 
 
 
400 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  42.07 
 
 
394 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
397 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  41.58 
 
 
404 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  41.53 
 
 
397 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  41.58 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
392 aa  326  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.62 
 
 
417 aa  325  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
398 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  40.61 
 
 
397 aa  325  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  39.95 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  40.46 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
393 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
393 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
393 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.95 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  40.46 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  40.46 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  40.46 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  40.46 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  40.46 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  40.46 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
383 aa  311  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.76 
 
 
406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 
399 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 
396 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 
396 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
395 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 
397 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
395 aa  292  7e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
395 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
395 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
399 aa  291  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 
440 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 
400 aa  290  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
406 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.25 
 
 
406 aa  288  8e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 
395 aa  285  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 
420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.34 
 
 
404 aa  282  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
407 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  40.32 
 
 
400 aa  282  9e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 
402 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
450 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 
402 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
340 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.17 
 
 
439 aa  276  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
405 aa  275  8e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  38.11 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  38.85 
 
 
416 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 
377 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  35.57 
 
 
416 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 
463 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  36.22 
 
 
402 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  36.15 
 
 
402 aa  269  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.87 
 
 
426 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.39 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.08 
 
 
446 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 
437 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  36.25 
 
 
395 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.09 
 
 
433 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
426 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
398 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 
430 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 
438 aa  262  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 
404 aa  262  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
433 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
395 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  35.25 
 
 
397 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
416 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 
401 aa  259  8e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 
446 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 
438 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000612  transcriptional regulator GntR family/aspartate aminotransferase  36.5 
 
 
382 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.379678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
436 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06472  aminotransferase  37.14 
 
 
382 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
398 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  36.29 
 
 
410 aa  256  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
402 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  36.29 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  35.96 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.51 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
441 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>