More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0073 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  91.48 
 
 		 402 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  99.25 
 
 		 402 aa  802    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 402 aa  807    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  57.61 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  56.6 
 
 		 395 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  58.23 
 
 		 400 aa  461  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 398 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  58.12 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  56.71 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  56.71 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  48.61 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  49.35 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  47.78 
 
 		 407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  47.06 
 
 		 399 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  46.79 
 
 		 417 aa  332  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  46.29 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  43.8 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  46.55 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 383 aa  319  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 		 394 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  43.26 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 425 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  42.89 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  44.36 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  44.7 
 
 		 377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  45.45 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  45.39 
 
 		 406 aa  302  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  42.05 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 395 aa  299  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  42.05 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 400 aa  298  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  42.42 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  42.38 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  43.95 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 395 aa  289  7e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 409 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  42.75 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  42.09 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  46.68 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  46.68 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  42.03 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  38.23 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.82 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  46.43 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  44.85 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.24 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  46.46 
 
 		 406 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.82 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.34 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 426 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  43.23 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  40.82 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  40.82 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 440 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  42.09 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  42.09 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  42.09 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  42.09 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  42.09 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  42.09 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.9 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 399 aa  275  7e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  38.11 
 
 		 386 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>