More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2212 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 468 aa  940    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  98.08 
 
 		 468 aa  924    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 477 aa  332  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.36 
 
 		 468 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.54 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.25 
 
 		 493 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 498 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 500 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 547 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  27.37 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 393 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 393 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 393 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.95 
 
 		 393 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  28.39 
 
 		 503 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 477 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.9 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  29.67 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 397 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.52 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  29.97 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  31.68 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2796  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 482 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  30.85 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  27.62 
 
 		 485 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 478 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.86 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  29.4 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1089  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 383 aa  183  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 398 aa  183  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.29 
 
 		 477 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 520 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.33 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.11 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.72 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  27.54 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.11 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 480 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 480 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 395 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  29.04 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  29.51 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2769  hypothetical protein  29.78 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2409  hypothetical protein  28.51 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2599  hypothetical protein  28.29 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.01409e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  27.58 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2363  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 394 aa  177  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  27.87 
 
 		 398 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>