More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0347 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  96.92 
 
 		 520 aa  1004    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 519 aa  1034    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  44.98 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  44.98 
 
 		 482 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  45.17 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  44.79 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  44.98 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 498 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.2 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 477 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.83 
 
 		 485 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 477 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 402 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 450 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 477 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 478 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  25.04 
 
 		 554 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 402 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  24.38 
 
 		 500 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  24.13 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 490 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.38 
 
 		 468 aa  193  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 480 aa  193  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  25.62 
 
 		 477 aa  193  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  26.75 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 480 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  26.94 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 394 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 480 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  27.08 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27.47 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  26.42 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  25.81 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.36 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 409 aa  176  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25.92 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 521 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.02 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.24 
 
 		 477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.01 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.01 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  25 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  26.01 
 
 		 406 aa  174  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 383 aa  173  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 506 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 399 aa  173  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  26.26 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.53 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.55 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.55 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  27.58 
 
 		 397 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  25.55 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 406 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  27.21 
 
 		 396 aa  171  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  27.53 
 
 		 399 aa  171  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.56 
 
 		 494 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.33 
 
 		 480 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  26.1 
 
 		 463 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 477 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>