More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1025 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
499 aa  958    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.74 
 
 
487 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  55.62 
 
 
492 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.94 
 
 
482 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
478 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
480 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
470 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
470 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.8 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
496 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
498 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
521 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.04 
 
 
508 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
470 aa  325  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
449 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  41.79 
 
 
487 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.08 
 
 
472 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.87 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.62 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.23 
 
 
489 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.02 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.87 
 
 
477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  35.63 
 
 
484 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 
456 aa  266  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
503 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 
485 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
504 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
475 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
503 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.61 
 
 
490 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.37 
 
 
475 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
491 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
501 aa  240  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 
496 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
494 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.43 
 
 
509 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.19 
 
 
485 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.3 
 
 
499 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.03 
 
 
485 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
490 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
494 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  34.86 
 
 
489 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
509 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
490 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.12 
 
 
488 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  34.97 
 
 
508 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  40 
 
 
493 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  40 
 
 
493 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 
494 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 
494 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
477 aa  230  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.48 
 
 
477 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.18 
 
 
488 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
477 aa  230  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  30.48 
 
 
477 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.48 
 
 
477 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.79 
 
 
494 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  39.91 
 
 
570 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  36.77 
 
 
495 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
509 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
496 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.46 
 
 
495 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
477 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
504 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.93 
 
 
510 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.15 
 
 
499 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 
496 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
496 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  33.27 
 
 
480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
490 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  32.41 
 
 
485 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  30.88 
 
 
477 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
574 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
470 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 
520 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  33.84 
 
 
498 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.35 
 
 
509 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  34.58 
 
 
504 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
485 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
477 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.98 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 
480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
487 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
485 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
475 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  35.83 
 
 
509 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
480 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.17 
 
 
480 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  29.48 
 
 
480 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.37 
 
 
483 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
480 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
477 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.7 
 
 
496 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
480 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
547 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.96 
 
 
480 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>