More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0865 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
404 aa  823    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 
398 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
398 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.97 
 
 
398 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.8 
 
 
393 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
393 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.02 
 
 
393 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.02 
 
 
393 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
393 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.76 
 
 
393 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.28 
 
 
417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
393 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.12 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
411 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.08 
 
 
393 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 
394 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 
396 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
399 aa  272  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 
400 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
411 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
411 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  34.44 
 
 
399 aa  268  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  35.73 
 
 
404 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
395 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 
463 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.42 
 
 
397 aa  263  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.55 
 
 
394 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
399 aa  263  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 
404 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
397 aa  262  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
395 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
395 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 
394 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  39.04 
 
 
406 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 
440 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
386 aa  258  9e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
410 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  34.89 
 
 
411 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  37.68 
 
 
400 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  35.48 
 
 
406 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.13 
 
 
395 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
397 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.41 
 
 
406 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  32.07 
 
 
446 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 
395 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 
611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.32 
 
 
410 aa  254  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  37.56 
 
 
410 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  36.58 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
395 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  34.77 
 
 
394 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
438 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 
377 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
450 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
398 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
406 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 
436 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 
430 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 
396 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 
396 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 
402 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 
402 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 
401 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
416 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.63 
 
 
436 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  32.75 
 
 
397 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 
437 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.46 
 
 
433 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 
386 aa  246  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  31.82 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  34.46 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  33.75 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
401 aa  244  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
398 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
408 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  34.55 
 
 
440 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  34.36 
 
 
406 aa  242  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 
400 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
398 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
441 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
441 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>