More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3001 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 383 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 383 aa  591  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.74 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  40.43 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.23 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  31.59 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.31 
 
 		 446 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.3 
 
 		 406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.67 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 406 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.89 
 
 		 517 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 611 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 398 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 441 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 430 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.88 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.17 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  35.7 
 
 		 416 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 437 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  35.45 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.6 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.71 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.4 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  32.7 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  35.98 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  36.17 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  33.33 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.27 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.17 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 426 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 435 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  35.47 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  35.47 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  35.47 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 450 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 547 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  32.73 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  35.83 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  33.77 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  36.55 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  31.81 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 401 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>