More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0315 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
403 aa  837    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 
400 aa  317  2e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 
463 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  39.45 
 
 
397 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
403 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  36.32 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
395 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
395 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
413 aa  280  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 
402 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
411 aa  278  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 
402 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.25 
 
 
393 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 
393 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 
393 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
393 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 
393 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.44 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.88 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
383 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
395 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 
401 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.28 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
395 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.82 
 
 
436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.12 
 
 
393 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.94 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
393 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
393 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 
396 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.15 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 
398 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
397 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 
394 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
401 aa  263  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.11 
 
 
404 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.39 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
450 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
399 aa  262  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
411 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 
438 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.01 
 
 
417 aa  259  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
399 aa  259  7e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  35.35 
 
 
399 aa  259  8e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 
611 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
405 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 
432 aa  257  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  37.87 
 
 
402 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 
436 aa  257  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
398 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  37.12 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  37.12 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  35.29 
 
 
410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  37.12 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  37.12 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.56 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  37.12 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  37.12 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 
394 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  35.05 
 
 
410 aa  253  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 
395 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  33.17 
 
 
433 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.16 
 
 
446 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 
397 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1763  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 
417 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 
398 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 
396 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
395 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
397 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
398 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  36.72 
 
 
396 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
410 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
386 aa  247  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 
437 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
411 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
406 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.24 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 
414 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.73 
 
 
400 aa  243  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 
398 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 
394 aa  242  7e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.07 
 
 
406 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  38.7 
 
 
399 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
399 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
407 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
388 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  38.44 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  34.64 
 
 
420 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
398 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 
386 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  36.86 
 
 
398 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>