More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1642 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 390 aa  811    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 393 aa  305  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  37.89 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 400 aa  275  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  38.11 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.77 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.75 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.04 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.83 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.27 
 
 		 406 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.67 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 398 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  35.86 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  34.76 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.13 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.61 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  35.06 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.03 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  33.59 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.87 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  35.48 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.13 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.13 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.13 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.13 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.13 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.13 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 416 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 411 aa  242  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.34 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  36.41 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 411 aa  238  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  34.45 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  32.82 
 
 		 433 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.85 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  34.99 
 
 		 411 aa  235  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.15 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  35.31 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  32.3 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  31.95 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  33.33 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 426 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  31.31 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>