More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0861 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
392 aa  795    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  67.35 
 
 
391 aa  553  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  62.31 
 
 
399 aa  485  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  52.31 
 
 
401 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  51.41 
 
 
397 aa  425  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  46.04 
 
 
394 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 
396 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  43.11 
 
 
393 aa  361  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.86 
 
 
400 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.37 
 
 
394 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  40.36 
 
 
395 aa  326  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
388 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
399 aa  316  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.39 
 
 
404 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 
383 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.59 
 
 
393 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
393 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.64 
 
 
393 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 
397 aa  285  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.09 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  39.09 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
395 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.29 
 
 
406 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.83 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.83 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.59 
 
 
393 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.59 
 
 
393 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.59 
 
 
393 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.59 
 
 
393 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
395 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.59 
 
 
393 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.59 
 
 
393 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.05 
 
 
417 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
395 aa  276  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 
396 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 
396 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.07 
 
 
398 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  40.32 
 
 
406 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
397 aa  269  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  36.15 
 
 
397 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.44 
 
 
404 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.1 
 
 
406 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
386 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  37.97 
 
 
395 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  37.72 
 
 
404 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
406 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
398 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
407 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 
405 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  42.04 
 
 
400 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 
420 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
426 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.26 
 
 
377 aa  255  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
396 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  36.15 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  38.4 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 
395 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
398 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 
440 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
450 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 
402 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
402 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  38 
 
 
402 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 
402 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
435 aa  245  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
414 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  37.37 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 
463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
395 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 
340 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
408 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 
406 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 
401 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 
398 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.64 
 
 
439 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.46 
 
 
440 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  35.13 
 
 
446 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  34.75 
 
 
410 aa  236  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 
400 aa  236  7e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  34.75 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.92 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  33.85 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  35.28 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 
430 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 
438 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
441 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>