More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1984 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  100 
 
 
408 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  100 
 
 
408 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  99.75 
 
 
408 aa  799    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  95.44 
 
 
406 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0778  aminotransferase family protein  90.93 
 
 
371 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0679  aminotransferase family protein  90.93 
 
 
371 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1632  aminotransferase family protein  90.93 
 
 
371 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0567  aminotransferase family protein  90.93 
 
 
371 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  54.91 
 
 
398 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  54.91 
 
 
398 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  54.39 
 
 
399 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  54.39 
 
 
399 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
399 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  53.38 
 
 
424 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  53.13 
 
 
399 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  55.38 
 
 
399 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  51.54 
 
 
407 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  49.75 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  44.61 
 
 
395 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
398 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  44.36 
 
 
395 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  44.75 
 
 
400 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  46.68 
 
 
402 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  46.17 
 
 
402 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
396 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
395 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
393 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  47.42 
 
 
402 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  42.36 
 
 
397 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  48.15 
 
 
377 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
398 aa  293  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  48.28 
 
 
400 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.84 
 
 
463 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 
394 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
395 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
383 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  40.6 
 
 
394 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 
400 aa  285  7e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 
396 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
393 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 
396 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  41.6 
 
 
398 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  38.95 
 
 
397 aa  279  7e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
400 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  39.64 
 
 
400 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
403 aa  277  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  42.06 
 
 
393 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  41.09 
 
 
398 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
416 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  42.79 
 
 
421 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  41.27 
 
 
393 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  42.33 
 
 
393 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  42.06 
 
 
393 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  41.49 
 
 
438 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 
441 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.93 
 
 
436 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
393 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  43.39 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  42.3 
 
 
397 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 
396 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
399 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
393 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  41.27 
 
 
393 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  41.27 
 
 
393 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  39.34 
 
 
439 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.31 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 
420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.54 
 
 
404 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
398 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.15 
 
 
394 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 
410 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.85 
 
 
440 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.99 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 
386 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 
446 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  42.06 
 
 
393 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  42.06 
 
 
393 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  42.06 
 
 
393 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  42.06 
 
 
393 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
437 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  42.06 
 
 
393 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  36.15 
 
 
433 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  42.06 
 
 
393 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
426 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
426 aa  259  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.4 
 
 
400 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  39.48 
 
 
437 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 
437 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 
436 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 
396 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.99 
 
 
430 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
340 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 
394 aa  256  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>