More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5662 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 425 aa  848    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  53.47 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  52.72 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 399 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  50.49 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  50.24 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 399 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  49.5 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  52.02 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  48.17 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  43.5 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  43.5 
 
 		 396 aa  317  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  51.61 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  51.61 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  51.61 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  44.86 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.6 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0778  aminotransferase family protein  47.89 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1632  aminotransferase family protein  47.89 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0567  aminotransferase family protein  47.89 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0679  aminotransferase family protein  47.89 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  45.98 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  42.86 
 
 		 421 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  38.15 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 383 aa  269  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.31 
 
 		 377 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.97 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.42 
 
 		 393 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  39.44 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.01 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.91 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.91 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.4 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  36.05 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.15 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.68 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.27 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  34.99 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  36.99 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.82 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  38.23 
 
 		 406 aa  232  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 340 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.31 
 
 		 393 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.68 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.51 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 411 aa  229  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 611 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 435 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  37.15 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>