More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0044 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
440 aa  879    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  59.54 
 
 
436 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  58.99 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  59.29 
 
 
436 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  55 
 
 
438 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  55 
 
 
438 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  59.15 
 
 
439 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  56.35 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  54.77 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  57.4 
 
 
437 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  53.79 
 
 
445 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  55.13 
 
 
432 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  55.73 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  53.81 
 
 
441 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.27 
 
 
439 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  53.85 
 
 
468 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  54.28 
 
 
428 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  54.75 
 
 
426 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  49.41 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  52.9 
 
 
441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  49.28 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  48.52 
 
 
446 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  48.99 
 
 
443 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
455 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  46.71 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  49.55 
 
 
450 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  47.46 
 
 
468 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  49.87 
 
 
439 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  54.84 
 
 
415 aa  388  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.33 
 
 
444 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  49.23 
 
 
457 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.87 
 
 
444 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  45.48 
 
 
452 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.43 
 
 
445 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.43 
 
 
445 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  45.06 
 
 
480 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 
482 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  48.18 
 
 
482 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  50.52 
 
 
481 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.05 
 
 
444 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  47.8 
 
 
444 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 
438 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  47.24 
 
 
456 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  46.95 
 
 
422 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  47.24 
 
 
456 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  45.12 
 
 
483 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  47.2 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  47.12 
 
 
458 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 
429 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  43.78 
 
 
478 aa  352  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  43.78 
 
 
478 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  42.89 
 
 
479 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.07 
 
 
440 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  47.14 
 
 
451 aa  350  4e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 
478 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  47.02 
 
 
456 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  47.66 
 
 
451 aa  349  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 
478 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  48.72 
 
 
455 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  48.05 
 
 
458 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 
457 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  43.8 
 
 
479 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 
456 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  46.12 
 
 
498 aa  345  8e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.04 
 
 
461 aa  344  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  48.09 
 
 
428 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.26 
 
 
423 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  43.16 
 
 
479 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  48.33 
 
 
507 aa  341  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  43.17 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  45 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  47.27 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  46.84 
 
 
481 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.27 
 
 
452 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.87 
 
 
530 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  45.11 
 
 
484 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  44.34 
 
 
440 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  44.34 
 
 
440 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  45.62 
 
 
446 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  43.87 
 
 
440 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  44.03 
 
 
445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  46.75 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  44.1 
 
 
515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  45.41 
 
 
444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  43.43 
 
 
444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  45.71 
 
 
440 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  40.33 
 
 
437 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  45.01 
 
 
524 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  45.01 
 
 
524 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  45.01 
 
 
524 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  45.01 
 
 
530 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  45.01 
 
 
530 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  45.01 
 
 
524 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  45.01 
 
 
524 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  46.49 
 
 
526 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  42.44 
 
 
471 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  44.82 
 
 
515 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  46.39 
 
 
522 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  45.01 
 
 
521 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>