More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5148 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 413 aa  850    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  43.96 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  55.81 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  52.04 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  45.85 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  48.76 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  42.29 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  40.88 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  48.58 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  38.9 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  43.43 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  43.99 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  42.48 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  38.58 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  35.66 
 
 		 378 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  44.3 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  40.77 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  41.31 
 
 		 405 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  37.38 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  36.78 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  41.67 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  45.15 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  35.16 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  40.58 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  42.31 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  40.96 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  40 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  39.42 
 
 		 391 aa  229  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  43.61 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  38.85 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  41.7 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  39.42 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  41.69 
 
 		 375 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  40.91 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  39.21 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  40.89 
 
 		 392 aa  216  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  33.25 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  37.72 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  42.62 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  36.74 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  39.93 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  37.77 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  40.14 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  38.22 
 
 		 383 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  40.49 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  36.07 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  40.2 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  40.59 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  38.29 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  36.42 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  37.67 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  35.79 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  32.32 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  41.58 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  38.08 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  45.87 
 
 		 273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  37.46 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  32.69 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  35.13 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  37.01 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  35.84 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  32.26 
 
 		 371 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  32.31 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  31.89 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  32.42 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  37.15 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  29.75 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  28.61 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  33.8 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  33.46 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  33.06 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  31.07 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  30.53 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  32.34 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  35.47 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  34.95 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  33.74 
 
 		 308 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 344 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  32.67 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  35.23 
 
 		 334 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6792  anti-FecI sigma factor, FecR  30.36 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 315 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  32.5 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  38.15 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4825  anti-FecI sigma factor, FecR  32.84 
 
 		 328 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.04929  hitchhiker  0.00000000730448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  30.56 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3632  anti-FecI sigma factor, FecR  34.24 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.761465  normal  0.138815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  30.1 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3122  anti-FecI sigma factor, FecR  34.92 
 
 		 316 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0237449  normal  0.801665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1715  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 324 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  35.36 
 
 		 282 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3554  anti-FecI sigma factor, FecR  35.42 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.017329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3204  anti-FecI sigma factor, FecR  25.42 
 
 		 371 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619399  normal  0.25037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>