More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4537 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 200 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  25.14 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  20.34 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
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NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
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NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
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NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  22.36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
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