More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3173 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3173  histidine kinase  100 
 
 		 606 aa  1246    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286696  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3950  histidine kinase  32.73 
 
 		 589 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.365281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4099  histidine kinase  30.4 
 
 		 600 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  decreased coverage  0.000691518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1796  histidine kinase  25.35 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 731 aa  157  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  30.73 
 
 		 779 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  30.13 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 975 aa  150  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 579 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 645 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 974 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 862 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1350 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 790 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 970 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 823 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 713 aa  144  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.363366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 1058 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  30.85 
 
 		 556 aa  143  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  31.19 
 
 		 797 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  29.95 
 
 		 802 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  28.33 
 
 		 698 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 952 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1009 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00069  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  29.27 
 
 		 718 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.397596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 1154 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 602 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 846 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 606 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 741 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 1046 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 898 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.28 
 
 		 631 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  28.4 
 
 		 762 aa  137  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  29.21 
 
 		 725 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 1032 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  28.5 
 
 		 988 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 1014 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.15 
 
 		 738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 873 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 877 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 984 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  28.95 
 
 		 810 aa  135  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 969 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 687 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  29.76 
 
 		 987 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 667 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 907 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  28.18 
 
 		 952 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1068 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 864 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 853 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 870 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  29.44 
 
 		 858 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1331 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1070 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  28.12 
 
 		 1209 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 934 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 		 1137 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 697 aa  132  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  31.03 
 
 		 984 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 1127 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  28.21 
 
 		 710 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 593 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0459  regulator of pathogenicity factors  28.81 
 
 		 717 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 687 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 765 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.01 
 
 		 582 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  28.24 
 
 		 901 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  28.92 
 
 		 1077 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 		 1002 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.76 
 
 		 763 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 926 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 1172 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 1135 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  29.14 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 1596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  29.38 
 
 		 1023 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  29.2 
 
 		 1125 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  27.56 
 
 		 1885 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 1313 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 863 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  29.43 
 
 		 576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 973 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  28.74 
 
 		 641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0400  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 717 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 806 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  29.5 
 
 		 1135 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 1029 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1343  histidine kinase  28.67 
 
 		 713 aa  128  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0921834  normal  0.552971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 896 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  28.5 
 
 		 1132 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  29.83 
 
 		 948 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  29.41 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>