More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1343 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1343  histidine kinase  100 
 
 
713 aa  1465    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0921834  normal  0.552971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2992  histidine kinase  38.69 
 
 
908 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3093  histidine kinase  40.16 
 
 
554 aa  271  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.2154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  35.81 
 
 
762 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1310  histidine kinase  37.77 
 
 
927 aa  260  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28038  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
762 aa  260  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.16 
 
 
853 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  39.9 
 
 
1028 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.26 
 
 
968 aa  253  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
1135 aa  253  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
647 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.54 
 
 
582 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
1452 aa  252  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  41.19 
 
 
1023 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  36.97 
 
 
732 aa  251  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
1407 aa  250  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
974 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  39.9 
 
 
666 aa  249  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.42 
 
 
631 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
865 aa  247  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0091  histidine kinase  35.29 
 
 
660 aa  246  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.42 
 
 
738 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
973 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  40.36 
 
 
787 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
790 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1125 aa  244  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
827 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1066 aa  244  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
969 aa  244  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1229 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
647 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  41.26 
 
 
735 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
1078 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  38.68 
 
 
1125 aa  241  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  37.85 
 
 
900 aa  240  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
846 aa  241  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1433 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.6 
 
 
659 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
902 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
1127 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
881 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
969 aa  237  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
1313 aa  237  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 
717 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
860 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
947 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.51 
 
 
777 aa  235  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
759 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
907 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
1070 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
767 aa  234  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  40.11 
 
 
596 aa  234  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
847 aa  233  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 
1199 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  36.68 
 
 
651 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  38.08 
 
 
544 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  39.11 
 
 
794 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
781 aa  232  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1350 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
789 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.69 
 
 
655 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  38.77 
 
 
742 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
631 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
524 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
951 aa  231  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  38.07 
 
 
1026 aa  231  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
1362 aa  231  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  38.06 
 
 
810 aa  230  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  36.75 
 
 
651 aa  230  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
898 aa  230  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
765 aa  230  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.34 
 
 
1560 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
773 aa  230  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
641 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1055 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
863 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.89 
 
 
835 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
782 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
995 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
764 aa  229  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.88 
 
 
982 aa  228  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.99 
 
 
645 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
1064 aa  228  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
1050 aa  228  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1358 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
896 aa  227  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  36.62 
 
 
671 aa  227  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
676 aa  227  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  37.7 
 
 
559 aa  227  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
743 aa  227  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  35.41 
 
 
856 aa  226  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1116 aa  226  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
685 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.82 
 
 
1060 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  34.7 
 
 
678 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
902 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
932 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.77 
 
 
853 aa  226  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
882 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1271 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>