More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2036 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  100 
 
 		 403 aa  799    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  38.04 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 		 365 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  37 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  35.53 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  36.99 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  36.99 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.45 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.81 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  33.15 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.8 
 
 		 373 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.54 
 
 		 366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.08 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.15 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 442 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.24 
 
 		 419 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  42.26 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.67 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.6 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  27.86 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 852 aa  143  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  27.22 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 338 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 357 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  25.56 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  25.8 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 451 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 367 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  28.08 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  28.13 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.57 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29 
 
 		 349 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.4 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.33 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 665 aa  126  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  27.75 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  26.88 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  25.67 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.42 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>