More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2153 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 358 aa  685    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  47.38 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13163  permease  41.32 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.67 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.46 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.48 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  30.58 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  23.92 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.8 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  23.69 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  31.71 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  27 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.3 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  24.33 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  34.59 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  31.14 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  24.34 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  30.94 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  30.53 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.43 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26.79 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.78 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.48 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.41 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.04 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.05 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.46 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  27.41 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  27.41 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  27.14 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.56 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  27.41 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.56 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.04 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.5 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  27.41 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.65 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.41 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  27.41 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  25.89 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.9 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  23.05 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.93 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  25.78 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  22.67 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.07 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.73 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.42 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  25.97 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  24.34 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  24 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  23.53 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  23.53 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  24 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  23.77 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.1 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.59 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.09 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  24 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  23.42 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.37 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.22 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  29.1 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  29.1 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  23.28 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.19 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.88 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  27.27 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  29.1 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  23.5 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.81 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.78 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  24.14 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25.14 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  21.32 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.72 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.12 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.06 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  29.35 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  22.59 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  30.48 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  25.79 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.34 
 
 		 329 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.24 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>