More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0806 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0806  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 350 aa  706    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.117722  normal  0.388542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1280  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1875  3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 348 aa  248  8e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.722069 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0895  3-dehydroquinate synthase  38.97 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2111  3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.71054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1774  3-dehydroquinate synthase  36.6 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0788  3-dehydroquinate synthase  37.18 
 
 		 343 aa  222  9e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1941  3-dehydroquinate synthase  38.62 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  39.03 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  38.18 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1056  3-dehydroquinate synthase  35.48 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  38.08 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  39.58 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  37.46 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  44.49 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  36.63 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1820  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.774122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1438  3-dehydroquinate synthase  35.44 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000118856  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  37.75 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  36.24 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  34.48 
 
 		 363 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  39.13 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0786  3-dehydroquinate synthase  36.84 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0410044  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1265  3-dehydroquinate synthase  32.63 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07371  3-dehydroquinate synthase  34.48 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  35.19 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  35.74 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  33.86 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  34.03 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  38.14 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3553  3-dehydroquinate synthase  38.43 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286464  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  34.03 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  37.94 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  34.83 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  36.42 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1592  3-dehydroquinate synthase  37.98 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0778  3-dehydroquinate synthase  43.32 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  34.23 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  43.72 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  34.38 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  35.27 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  35.91 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  41.74 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  36.79 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  42.86 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  33.93 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  41.55 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  34.69 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_410  3-dehydroquinate synthase  35.79 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.246623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  40.51 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0104  3-dehydroquinate synthase  38.57 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  36.96 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  36.36 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  35.9 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0467  3-dehydroquinate synthase  35.42 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0121882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  40.85 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15571  3-dehydroquinate synthase  38.13 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.341963 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  36.5 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0444  3-dehydroquinate synthase  35.16 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  33.14 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0529  3-dehydroquinate synthase  39.19 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  36.86 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  35.49 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07551  3-dehydroquinate synthase  37.01 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  34.93 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1514  3-dehydroquinate synthase  33.13 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12560  3-dehydroquinate synthase  36.54 
 
 		 593 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100875  normal  0.530039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2358  3-dehydroquinate synthase  33.21 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  36.2 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  35.77 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1556  3-dehydroquinate synthase  40.99 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  35.97 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1050  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0440827  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  36.43 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  33.02 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  37.14 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0047  3-dehydroquinate synthase  38.63 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  34.42 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  34.74 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  35.77 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  34.51 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  37.97 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  38.49 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  35.09 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  34.18 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  34.97 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1026  3-dehydroquinate synthase  36.13 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  34.51 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  35.21 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>