136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0951 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0951  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
330 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0214706  normal  0.0588127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0837  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.73 
 
 
285 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2758  TPR repeat-containing protein  38.23 
 
 
414 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.94 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 
599 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  36.72 
 
 
482 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0823  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  31.08 
 
 
470 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174459  normal  0.603656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
573 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0049  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.492583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 
878 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.15 
 
 
684 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.52 
 
 
789 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
255 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 
810 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.64 
 
 
816 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
543 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
754 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0338  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.94 
 
 
1402 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
685 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  28.52 
 
 
471 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4770  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.95 
 
 
383 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 
754 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
4079 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.32 
 
 
489 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.05 
 
 
961 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 
842 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.18 
 
 
685 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.71 
 
 
732 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
808 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.29 
 
 
632 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  26.06 
 
 
831 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  38.06 
 
 
725 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03010  Sel1 repeat protein  28.38 
 
 
291 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
909 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  32.76 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.03 
 
 
782 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.89 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
750 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
374 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
465 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.74 
 
 
764 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
792 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
739 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
681 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.64 
 
 
653 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.8 
 
 
1764 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
653 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  25.87 
 
 
490 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1507  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.13 
 
 
229 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
718 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.48 
 
 
887 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  28.44 
 
 
512 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0265  Sel1 domain-containing protein  28.02 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
1032 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
689 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
505 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
637 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 
464 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.34 
 
 
622 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  20.63 
 
 
733 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0340  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
828 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
602 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.56 
 
 
1493 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48786  predicted protein  36.67 
 
 
959 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  30.36 
 
 
272 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  31.42 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
955 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.17 
 
 
2413 aa  47.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  34.15 
 
 
321 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2272  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.33 
 
 
363 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  27.5 
 
 
557 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
1737 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
828 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
827 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  42.22 
 
 
615 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
512 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
612 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
448 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  27.98 
 
 
512 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  26.9 
 
 
490 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 
2240 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
1600 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.08 
 
 
585 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
927 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5815  Tetratricopeptide TPR_4  41.33 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
597 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.23 
 
 
725 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.46 
 
 
661 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.82 
 
 
739 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  24.83 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>